Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 ASPH-213ENST00000518441 781 ntTSL 27.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 26.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-229ENST00000524173 587 ntTSL 46.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-216ENST00000519678 536 ntTSL 34.39□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP294-201ENST00000362770 338 ntBASIC8.79□□□□□ -16e-11■■■■■ 75.3
LARP7Q4G0J3 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 74.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.79□□□□□ -1.327e-12■■■■■ 74.3
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 49.48□□□□□ -0.892e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 49.48□□□□□ -0.892e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.14□□□□□ -0.952e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.042e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.02□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.13□□□□□ -1.272e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 46.71□□□□□ -1.342e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.462e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 73.4
LARP7Q4G0J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 PLBD1-203ENST00000541618 857 ntTSL 518.89■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP134-201ENST00000363960 269 ntBASIC9.68□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 PLBD1-202ENST00000540572 553 ntTSL 55.95□□□□□ -1.467e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 71.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.28□□□□□ -1.246e-11■■■■■ 70.5
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.161e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.261e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.341e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.64□□□□□ -1.351e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.461e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 55.63□□□□□ -1.511e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.42□□□□□ -1.71e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.751e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.05□□□□□ -1.761e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7.78□□□□□ -1.168e-17■■■■■ 68
LARP7Q4G0J3 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 67.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.61□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 67.1
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 223.13■■□□□ 1.291e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 510.83□□□□□ -0.681e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.791e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.881e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.451e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 413.85□□□□□ -0.191e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 213.71□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 210.93□□□□□ -0.661e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 34.7□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.731e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.5□□□□□ -1.859e-10■■■■■ 63.2
LARP7Q4G0J3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.27□□□□□ -1.251e-323■■■■■ 62.4
LARP7Q4G0J3 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 29.46□□□□□ -0.92e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 59.25□□□□□ -0.932e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.282e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 36.97□□□□□ -1.292e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 57.91□□□□□ -1.145e-11■■■■■ 61.9
LARP7Q4G0J3 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.15□□□□□ -1.265e-11■■■■■ 61.9
LARP7Q4G0J3 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.794e-37■■■■■ 61.8
LARP7Q4G0J3 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 59.7
LARP7Q4G0J3 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 59.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 59.7
LARP7Q4G0J3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.939e-63■■■■■ 59.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 26.66□□□□□ -1.341e-30■■■■■ 57.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.5□□□□□ -1.691e-30■■■■■ 57.3
LARP7Q4G0J3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 313.84□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 511.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 57.1
LARP7Q4G0J3 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.095e-17■■■■■ 56.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC7.58□□□□□ -1.29e-9■■■■■ 56.4
LARP7Q4G0J3 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-17■■■■■ 55.5
LARP7Q4G0J3 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.71□□□□□ -1.342e-17■■■■■ 55.5
LARP7Q4G0J3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 39.25□□□□□ -0.931e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 28.49□□□□□ -1.051e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 37.83□□□□□ -1.161e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 36.57□□□□□ -1.361e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 25.83□□□□□ -1.481e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.491e-30■■■■■ 53.9
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