Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 ASPH-213ENST00000518441 781 ntTSL 27.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 26.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-229ENST00000524173 587 ntTSL 46.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-216ENST00000519678 536 ntTSL 34.39□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP294-201ENST00000362770 338 ntBASIC8.79□□□□□ -16e-11■■■■■ 75.3
LARP7Q4G0J3 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 74.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.79□□□□□ -1.327e-12■■■■■ 74.3
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 49.48□□□□□ -0.892e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 49.48□□□□□ -0.892e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.14□□□□□ -0.952e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.042e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.02□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.13□□□□□ -1.272e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 46.71□□□□□ -1.342e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.462e-17■■■■■ 73.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 73.4
LARP7Q4G0J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 PLBD1-203ENST00000541618 857 ntTSL 518.89■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP134-201ENST00000363960 269 ntBASIC9.68□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 PLBD1-202ENST00000540572 553 ntTSL 55.95□□□□□ -1.467e-7■■■■■ 71.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 71.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.28□□□□□ -1.246e-11■■■■■ 70.5
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 69.1
LARP7Q4G0J3 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.161e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.261e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.341e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.64□□□□□ -1.351e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.461e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 55.63□□□□□ -1.511e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.42□□□□□ -1.71e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.751e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.05□□□□□ -1.761e-35■■■■■ 68.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7.78□□□□□ -1.168e-17■■■■■ 68
LARP7Q4G0J3 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 67.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.61□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 67.1
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 223.13■■□□□ 1.291e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 510.83□□□□□ -0.681e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.791e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.881e-30■■■■■ 65.7
LARP7Q4G0J3 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.451e-11■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 413.85□□□□□ -0.191e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 213.71□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 210.93□□□□□ -0.661e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 34.7□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.731e-323■■■■■ 65.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.5□□□□□ -1.859e-10■■■■■ 63.2
LARP7Q4G0J3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.27□□□□□ -1.251e-323■■■■■ 62.4
LARP7Q4G0J3 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 29.46□□□□□ -0.92e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 59.25□□□□□ -0.932e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.282e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 36.97□□□□□ -1.292e-30■■■■■ 62.3
LARP7Q4G0J3 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 57.91□□□□□ -1.145e-11■■■■■ 61.9
LARP7Q4G0J3 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.15□□□□□ -1.265e-11■■■■■ 61.9
LARP7Q4G0J3 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.794e-37■■■■■ 61.8
LARP7Q4G0J3 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 59.7
LARP7Q4G0J3 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 59.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 59.7
LARP7Q4G0J3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.939e-63■■■■■ 59.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 26.66□□□□□ -1.341e-30■■■■■ 57.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.5□□□□□ -1.691e-30■■■■■ 57.3
LARP7Q4G0J3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 313.84□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 511.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 57.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 57.1
LARP7Q4G0J3 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.095e-17■■■■■ 56.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC7.58□□□□□ -1.29e-9■■■■■ 56.4
LARP7Q4G0J3 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-17■■■■■ 55.5
LARP7Q4G0J3 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.71□□□□□ -1.342e-17■■■■■ 55.5
LARP7Q4G0J3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 39.25□□□□□ -0.931e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 28.49□□□□□ -1.051e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 37.83□□□□□ -1.161e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 36.57□□□□□ -1.361e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 25.83□□□□□ -1.481e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.491e-30■■■■■ 53.9
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