Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBRG1Q3YBR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBRG1Q3YBR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBRG1Q3YBR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TBRG1Q3YBR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBRG1Q3YBR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TBRG1Q3YBR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms