Protein–RNA interactions for Protein: Q3KRA9

ALKBH6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH6Q3KRA9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH6Q3KRA9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH6Q3KRA9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH6Q3KRA9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH6Q3KRA9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALKBH6Q3KRA9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH6Q3KRA9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALKBH6Q3KRA9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH6Q3KRA9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKBH6Q3KRA9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms