Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCAQ16586 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCAQ16586 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGCAQ16586 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCAQ16586 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCAQ16586 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCAQ16586 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCAQ16586 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCAQ16586 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms