Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDC37Q16543 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDC37Q16543 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDC37Q16543 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CDC37Q16543 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDC37Q16543 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDC37Q16543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CDC37Q16543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDC37Q16543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDC37Q16543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDC37Q16543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDC37Q16543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDC37Q16543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC37Q16543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDC37Q16543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDC37Q16543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDC37Q16543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC37Q16543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
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