Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAD1Q15797 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD1Q15797 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD1Q15797 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD1Q15797 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD1Q15797 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD1Q15797 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD1Q15797 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD1Q15797 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD1Q15797 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMAD1Q15797 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD1Q15797 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD1Q15797 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMAD1Q15797 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD1Q15797 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMAD1Q15797 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD1Q15797 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms