Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCEA2Q15560 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCEA2Q15560 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCEA2Q15560 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCEA2Q15560 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCEA2Q15560 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCEA2Q15560 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCEA2Q15560 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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