Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFRLQ15198 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFRLQ15198 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFRLQ15198 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFRLQ15198 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFRLQ15198 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFRLQ15198 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFRLQ15198 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFRLQ15198 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFRLQ15198 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFRLQ15198 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFRLQ15198 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFRLQ15198 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
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