Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCM1Q15154 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCM1Q15154 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCM1Q15154 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCM1Q15154 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCM1Q15154 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCM1Q15154 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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