Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD1Q15116 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD1Q15116 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCD1Q15116 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCD1Q15116 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD1Q15116 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD1Q15116 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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