Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC3Q15034 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HERC3Q15034 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HERC3Q15034 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC3Q15034 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC3Q15034 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC3Q15034 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC3Q15034 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC3Q15034 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC3Q15034 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC3Q15034 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC3Q15034 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC3Q15034 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC3Q15034 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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