Protein–RNA interactions for Protein: Q14766

LTBP1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1Q14766 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP1Q14766 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP1Q14766 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP1Q14766 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP1Q14766 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP1Q14766 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTBP1Q14766 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP1Q14766 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP1Q14766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP1Q14766 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP1Q14766 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP1Q14766 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTBP1Q14766 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTBP1Q14766 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LTBP1Q14766 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LTBP1Q14766 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTBP1Q14766 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LTBP1Q14766 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LTBP1Q14766 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms