Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPRIN1Q14444 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPRIN1Q14444 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN1Q14444 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN1Q14444 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN1Q14444 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPRIN1Q14444 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPRIN1Q14444 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN1Q14444 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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