Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERV3-1Q14264 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERV3-1Q14264 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERV3-1Q14264 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERV3-1Q14264 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERV3-1Q14264 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERV3-1Q14264 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERV3-1Q14264 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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