Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1DQ13901 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1DQ13901 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1DQ13901 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1DQ13901 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1DQ13901 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1DQ13901 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1DQ13901 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1DQ13901 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1DQ13901 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1DQ13901 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1DQ13901 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1DQ13901 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1DQ13901 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1DQ13901 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1DQ13901 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1DQ13901 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1DQ13901 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1DQ13901 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1DQ13901 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1DQ13901 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1DQ13901 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1DQ13901 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1DQ13901 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C1DQ13901 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1DQ13901 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1DQ13901 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1DQ13901 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1DQ13901 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1DQ13901 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1DQ13901 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1DQ13901 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1DQ13901 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1DQ13901 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1DQ13901 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1DQ13901 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1DQ13901 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1DQ13901 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1DQ13901 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1DQ13901 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1DQ13901 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1DQ13901 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1DQ13901 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1DQ13901 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1DQ13901 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1DQ13901 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1DQ13901 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1DQ13901 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1DQ13901 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1DQ13901 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1DQ13901 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1DQ13901 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1DQ13901 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1DQ13901 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1DQ13901 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1DQ13901 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1DQ13901 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1DQ13901 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1DQ13901 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1DQ13901 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1DQ13901 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1DQ13901 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1DQ13901 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1DQ13901 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1DQ13901 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1DQ13901 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1DQ13901 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1DQ13901 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1DQ13901 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1DQ13901 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1DQ13901 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1DQ13901 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1DQ13901 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1DQ13901 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1DQ13901 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1DQ13901 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1DQ13901 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1DQ13901 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1DQ13901 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1DQ13901 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1DQ13901 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1DQ13901 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1DQ13901 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1DQ13901 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1DQ13901 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1DQ13901 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1DQ13901 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1DQ13901 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1DQ13901 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1DQ13901 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1DQ13901 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1DQ13901 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1DQ13901 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1DQ13901 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1DQ13901 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1DQ13901 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1DQ13901 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1DQ13901 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1DQ13901 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1DQ13901 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms