Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX39BQ13838 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX39BQ13838 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX39BQ13838 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX39BQ13838 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX39BQ13838 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39BQ13838 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX39BQ13838 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39BQ13838 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39BQ13838 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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