Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB3Q13751 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB3Q13751 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB3Q13751 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAMB3Q13751 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB3Q13751 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMB3Q13751 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB3Q13751 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB3Q13751 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMB3Q13751 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMB3Q13751 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB3Q13751 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB3Q13751 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB3Q13751 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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