Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A4Q13733 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A4Q13733 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP1A4Q13733 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A4Q13733 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A4Q13733 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP1A4Q13733 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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