Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPS1Q13098 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GPS1Q13098 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPS1Q13098 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPS1Q13098 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPS1Q13098 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPS1Q13098 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPS1Q13098 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPS1Q13098 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GPS1Q13098 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPS1Q13098 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPS1Q13098 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GPS1Q13098 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPS1Q13098 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPS1Q13098 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GPS1Q13098 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPS1Q13098 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPS1Q13098 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPS1Q13098 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GPS1Q13098 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GPS1Q13098 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GPS1Q13098 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPS1Q13098 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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