Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAF1Q13077 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAF1Q13077 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAF1Q13077 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAF1Q13077 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRAF1Q13077 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAF1Q13077 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAF1Q13077 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAF1Q13077 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAF1Q13077 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAF1Q13077 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAF1Q13077 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAF1Q13077 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
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