Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXL1Q12952 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXL1Q12952 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXL1Q12952 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXL1Q12952 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXL1Q12952 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXL1Q12952 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXL1Q12952 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXL1Q12952 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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