Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMAN2Q12907 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMAN2Q12907 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMAN2Q12907 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMAN2Q12907 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN2Q12907 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMAN2Q12907 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMAN2Q12907 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMAN2Q12907 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMAN2Q12907 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMAN2Q12907 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMAN2Q12907 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMAN2Q12907 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMAN2Q12907 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMAN2Q12907 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMAN2Q12907 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMAN2Q12907 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMAN2Q12907 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMAN2Q12907 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMAN2Q12907 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN2Q12907 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
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