Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 54.2□□□□□ -1.748e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 43.78□□□□□ -1.88e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.138e-14■■■■■ 40.3
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ILF3Q12906 CHPT1-206ENST00000550385 754 ntTSL 510.4□□□□□ -0.745e-10■■■■■ 40
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ILF3Q12906 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.497e-12■■■■■ 39.7
ILF3Q12906 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 39.5
ILF3Q12906 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 58.47□□□□□ -1.056e-9■■■■■ 39.5
ILF3Q12906 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.336e-9■■■■■ 39.5
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ILF3Q12906 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 39
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ILF3Q12906 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 38.9
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ILF3Q12906 PRIMPOL-202ENST00000503752 2168 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 PRIMPOL-203ENST00000506278 1138 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 38.9
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ILF3Q12906 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.677e-12■■■■■ 38.6
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ILF3Q12906 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.127e-12■■■■■ 38.6
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ILF3Q12906 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 38.3
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ILF3Q12906 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 38.1
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ILF3Q12906 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 38.1
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ILF3Q12906 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 513.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-11■■■■■ 38.1
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ILF3Q12906 POU2F1-213ENST00000557909 588 ntTSL 410.62□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 38.1
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ILF3Q12906 POU2F1-214ENST00000559038 557 ntTSL 49.19□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 38.1
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ILF3Q12906 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 PGM1-203ENST00000473117 373 ntTSL 57.53□□□□□ -1.22e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 24.86□□□□□ -1.632e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.742e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 412.36□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 515.67■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.55□□□□□ -0.562e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 311.16□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 217.11■□□□□ 0.331e-11■■■■■ 37.9
ILF3Q12906 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-11■■■■■ 37.9
ILF3Q12906 PARN-213ENST00000564904 468 ntTSL 53.48□□□□□ -1.859e-13■■■■■ 37.6
ILF3Q12906 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 37.5
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 52.1 ms