Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1BQ0VAM2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGEF1BQ0VAM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1BQ0VAM2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1BQ0VAM2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms