Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4CQ08493 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4CQ08493 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4CQ08493 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4CQ08493 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4CQ08493 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4CQ08493 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4CQ08493 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4CQ08493 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms