Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF9Q07011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF9Q07011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF9Q07011 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF9Q07011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFRSF9Q07011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF9Q07011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms