Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD51Q06609 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAD51Q06609 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD51Q06609 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD51Q06609 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD51Q06609 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD51Q06609 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD51Q06609 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD51Q06609 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD51Q06609 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAD51Q06609 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD51Q06609 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD51Q06609 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD51Q06609 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD51Q06609 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD51Q06609 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD51Q06609 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms