Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIBQ01892 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIBQ01892 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIBQ01892 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIBQ01892 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIBQ01892 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIBQ01892 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIBQ01892 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIBQ01892 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms