Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKPQ01813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKPQ01813 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKPQ01813 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKPQ01813 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKPQ01813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKPQ01813 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKPQ01813 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKPQ01813 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKPQ01813 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKPQ01813 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKPQ01813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PFKPQ01813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKPQ01813 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKPQ01813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKPQ01813 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKPQ01813 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PFKPQ01813 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms