Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALK2Q01415 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALK2Q01415 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALK2Q01415 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALK2Q01415 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALK2Q01415 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALK2Q01415 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALK2Q01415 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms