Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKB2Q00653 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKB2Q00653 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKB2Q00653 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKB2Q00653 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKB2Q00653 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKB2Q00653 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NFKB2Q00653 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFKB2Q00653 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKB2Q00653 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms