Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FANCCQ00597 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FANCCQ00597 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FANCCQ00597 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FANCCQ00597 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FANCCQ00597 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FANCCQ00597 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FANCCQ00597 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCCQ00597 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCCQ00597 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCCQ00597 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCCQ00597 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCCQ00597 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCCQ00597 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCCQ00597 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FANCCQ00597 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCCQ00597 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCCQ00597 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms