Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF2BQ00403 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2BQ00403 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF2BQ00403 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2BQ00403 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2BQ00403 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2BQ00403 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2BQ00403 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2BQ00403 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2BQ00403 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF2BQ00403 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2BQ00403 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF2BQ00403 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2BQ00403 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms