Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63121 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63121 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63121 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63121 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63121 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms