Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL31P62899 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL31P62899 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL31P62899 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL31P62899 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL31P62899 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL31P62899 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL31P62899 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL31P62899 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL31P62899 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL31P62899 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL31P62899 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL31P62899 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL31P62899 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL31P62899 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL31P62899 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL31P62899 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL31P62899 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL31P62899 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL31P62899 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL31P62899 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL31P62899 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL31P62899 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL31P62899 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL31P62899 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL31P62899 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL31P62899 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL31P62899 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL31P62899 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL31P62899 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL31P62899 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL31P62899 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL31P62899 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL31P62899 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL31P62899 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL31P62899 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL31P62899 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL31P62899 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL31P62899 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL31P62899 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL31P62899 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL31P62899 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL31P62899 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL31P62899 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL31P62899 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL31P62899 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL31P62899 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL31P62899 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL31P62899 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL31P62899 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL31P62899 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL31P62899 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL31P62899 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL31P62899 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL31P62899 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL31P62899 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL31P62899 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL31P62899 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL31P62899 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL31P62899 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL31P62899 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL31P62899 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL31P62899 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL31P62899 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL31P62899 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPL31P62899 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL31P62899 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL31P62899 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL31P62899 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL31P62899 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL31P62899 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL31P62899 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL31P62899 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL31P62899 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL31P62899 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL31P62899 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL31P62899 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL31P62899 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL31P62899 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL31P62899 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL31P62899 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL31P62899 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL31P62899 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL31P62899 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL31P62899 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL31P62899 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL31P62899 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL31P62899 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL31P62899 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL31P62899 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL31P62899 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL31P62899 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL31P62899 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL31P62899 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL31P62899 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL31P62899 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL31P62899 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL31P62899 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL31P62899 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL31P62899 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms