Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK11-1P61568 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK11-1P61568 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK11-1P61568 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK11-1P61568 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVK11-1P61568 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK11-1P61568 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK11-1P61568 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK11-1P61568 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK11-1P61568 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms