Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTP1P59025 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTP1P59025 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RTP1P59025 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTP1P59025 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTP1P59025 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTP1P59025 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTP1P59025 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTP1P59025 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTP1P59025 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTP1P59025 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTP1P59025 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTP1P59025 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTP1P59025 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTP1P59025 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTP1P59025 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTP1P59025 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTP1P59025 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTP1P59025 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTP1P59025 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTP1P59025 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTP1P59025 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTP1P59025 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RTP1P59025 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RTP1P59025 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTP1P59025 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTP1P59025 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RTP1P59025 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTP1P59025 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RTP1P59025 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RTP1P59025 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RTP1P59025 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RTP1P59025 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTP1P59025 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTP1P59025 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RTP1P59025 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTP1P59025 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTP1P59025 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RTP1P59025 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTP1P59025 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTP1P59025 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTP1P59025 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RTP1P59025 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RTP1P59025 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTP1P59025 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTP1P59025 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RTP1P59025 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RTP1P59025 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RTP1P59025 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RTP1P59025 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RTP1P59025 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RTP1P59025 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RTP1P59025 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RTP1P59025 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RTP1P59025 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RTP1P59025 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RTP1P59025 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTP1P59025 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTP1P59025 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTP1P59025 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTP1P59025 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTP1P59025 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RTP1P59025 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTP1P59025 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTP1P59025 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTP1P59025 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTP1P59025 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RTP1P59025 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RTP1P59025 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RTP1P59025 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTP1P59025 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTP1P59025 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTP1P59025 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTP1P59025 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RTP1P59025 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RTP1P59025 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RTP1P59025 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RTP1P59025 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTP1P59025 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTP1P59025 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTP1P59025 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RTP1P59025 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTP1P59025 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTP1P59025 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTP1P59025 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RTP1P59025 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RTP1P59025 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RTP1P59025 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RTP1P59025 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RTP1P59025 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RTP1P59025 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RTP1P59025 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RTP1P59025 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RTP1P59025 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RTP1P59025 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RTP1P59025 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RTP1P59025 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RTP1P59025 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RTP1P59025 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RTP1P59025 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms