Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RWDD2BP57060 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RWDD2BP57060 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RWDD2BP57060 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RWDD2BP57060 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RWDD2BP57060 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD2BP57060 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RWDD2BP57060 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD2BP57060 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RWDD2BP57060 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD2BP57060 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD2BP57060 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RWDD2BP57060 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms