Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA1P56159 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA1P56159 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA1P56159 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA1P56159 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA1P56159 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA1P56159 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA1P56159 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA1P56159 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms