Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CASP7P55210 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CASP7P55210 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CASP7P55210 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CASP7P55210 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CASP7P55210 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CASP7P55210 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CASP7P55210 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CASP7P55210 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASP7P55210 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASP7P55210 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASP7P55210 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASP7P55210 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASP7P55210 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CASP7P55210 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASP7P55210 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASP7P55210 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CASP7P55210 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASP7P55210 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASP7P55210 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASP7P55210 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CASP7P55210 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CASP7P55210 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CASP7P55210 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CASP7P55210 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CASP7P55210 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CASP7P55210 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CASP7P55210 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CASP7P55210 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CASP7P55210 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CASP7P55210 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CASP7P55210 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CASP7P55210 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CASP7P55210 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CASP7P55210 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CASP7P55210 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CASP7P55210 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CASP7P55210 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CASP7P55210 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CASP7P55210 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CASP7P55210 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CASP7P55210 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CASP7P55210 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASP7P55210 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASP7P55210 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASP7P55210 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CASP7P55210 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASP7P55210 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASP7P55210 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASP7P55210 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CASP7P55210 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CASP7P55210 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CASP7P55210 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASP7P55210 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASP7P55210 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CASP7P55210 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CASP7P55210 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CASP7P55210 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CASP7P55210 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CASP7P55210 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CASP7P55210 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASP7P55210 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASP7P55210 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASP7P55210 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CASP7P55210 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CASP7P55210 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASP7P55210 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CASP7P55210 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CASP7P55210 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CASP7P55210 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CASP7P55210 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASP7P55210 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASP7P55210 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASP7P55210 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASP7P55210 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASP7P55210 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CASP7P55210 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CASP7P55210 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CASP7P55210 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CASP7P55210 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CASP7P55210 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CASP7P55210 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CASP7P55210 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CASP7P55210 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CASP7P55210 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CASP7P55210 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CASP7P55210 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CASP7P55210 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CASP7P55210 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CASP7P55210 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CASP7P55210 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CASP7P55210 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CASP7P55210 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CASP7P55210 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CASP7P55210 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CASP7P55210 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CASP7P55210 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CASP7P55210 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CASP7P55210 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CASP7P55210 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms