Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BRPF1P55201 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
BRPF1P55201 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BRPF1P55201 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
BRPF1P55201 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BRPF1P55201 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
BRPF1P55201 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BRPF1P55201 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BRPF1P55201 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BRPF1P55201 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRPF1P55201 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BRPF1P55201 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRPF1P55201 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms