Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN5P54829 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN5P54829 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN5P54829 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN5P54829 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN5P54829 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN5P54829 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN5P54829 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN5P54829 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN5P54829 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN5P54829 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN5P54829 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms