Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA2D1P54289 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CACNA2D1P54289 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA2D1P54289 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA2D1P54289 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA2D1P54289 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA2D1P54289 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D1P54289 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D1P54289 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms