Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
AP3M2P53677 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AP3M2P53677 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AP3M2P53677 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
AP3M2P53677 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AP3M2P53677 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AP3M2P53677 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AP3M2P53677 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms