Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDR1P51861 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDR1P51861 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDR1P51861 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDR1P51861 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDR1P51861 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDR1P51861 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDR1P51861 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDR1P51861 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDR1P51861 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDR1P51861 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDR1P51861 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDR1P51861 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDR1P51861 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDR1P51861 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDR1P51861 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDR1P51861 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDR1P51861 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDR1P51861 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CDR1P51861 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDR1P51861 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDR1P51861 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDR1P51861 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDR1P51861 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDR1P51861 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDR1P51861 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDR1P51861 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDR1P51861 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDR1P51861 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDR1P51861 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDR1P51861 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDR1P51861 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDR1P51861 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDR1P51861 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDR1P51861 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDR1P51861 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDR1P51861 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDR1P51861 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDR1P51861 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDR1P51861 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDR1P51861 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDR1P51861 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDR1P51861 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDR1P51861 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDR1P51861 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDR1P51861 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDR1P51861 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDR1P51861 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDR1P51861 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDR1P51861 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDR1P51861 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDR1P51861 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDR1P51861 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDR1P51861 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDR1P51861 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDR1P51861 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDR1P51861 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDR1P51861 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDR1P51861 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDR1P51861 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDR1P51861 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDR1P51861 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDR1P51861 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDR1P51861 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDR1P51861 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDR1P51861 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDR1P51861 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDR1P51861 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDR1P51861 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDR1P51861 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDR1P51861 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDR1P51861 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDR1P51861 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDR1P51861 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDR1P51861 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDR1P51861 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDR1P51861 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDR1P51861 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDR1P51861 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDR1P51861 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDR1P51861 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDR1P51861 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDR1P51861 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDR1P51861 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms