Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNA2P51530 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNA2P51530 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNA2P51530 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNA2P51530 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNA2P51530 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNA2P51530 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNA2P51530 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNA2P51530 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNA2P51530 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DNA2P51530 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNA2P51530 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNA2P51530 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNA2P51530 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNA2P51530 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNA2P51530 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNA2P51530 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNA2P51530 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNA2P51530 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNA2P51530 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNA2P51530 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNA2P51530 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNA2P51530 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNA2P51530 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNA2P51530 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNA2P51530 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNA2P51530 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNA2P51530 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNA2P51530 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNA2P51530 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNA2P51530 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNA2P51530 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNA2P51530 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DNA2P51530 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DNA2P51530 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNA2P51530 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNA2P51530 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNA2P51530 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DNA2P51530 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNA2P51530 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNA2P51530 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNA2P51530 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNA2P51530 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNA2P51530 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNA2P51530 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNA2P51530 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNA2P51530 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNA2P51530 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNA2P51530 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNA2P51530 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNA2P51530 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNA2P51530 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNA2P51530 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNA2P51530 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNA2P51530 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNA2P51530 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNA2P51530 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNA2P51530 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNA2P51530 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNA2P51530 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNA2P51530 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNA2P51530 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNA2P51530 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNA2P51530 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNA2P51530 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNA2P51530 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNA2P51530 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNA2P51530 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNA2P51530 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNA2P51530 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNA2P51530 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNA2P51530 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNA2P51530 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNA2P51530 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNA2P51530 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNA2P51530 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DNA2P51530 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNA2P51530 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNA2P51530 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNA2P51530 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNA2P51530 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DNA2P51530 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNA2P51530 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNA2P51530 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNA2P51530 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNA2P51530 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNA2P51530 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNA2P51530 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNA2P51530 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNA2P51530 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNA2P51530 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNA2P51530 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNA2P51530 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNA2P51530 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNA2P51530 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNA2P51530 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNA2P51530 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNA2P51530 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNA2P51530 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNA2P51530 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms