Protein–RNA interactions for Protein: P51149

RAB7A, Ras-related protein Rab-7a, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7AP51149 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7AP51149 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7AP51149 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7AP51149 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB7AP51149 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7AP51149 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7AP51149 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7AP51149 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB7AP51149 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms