Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MTHFSP49914 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MTHFSP49914 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
MTHFSP49914 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
MTHFSP49914 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
MTHFSP49914 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
MTHFSP49914 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MTHFSP49914 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MTHFSP49914 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
MTHFSP49914 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MTHFSP49914 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MTHFSP49914 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
MTHFSP49914 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MTHFSP49914 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MTHFSP49914 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms