Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A3P48764 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A3P48764 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A3P48764 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A3P48764 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A3P48764 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A3P48764 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms