Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRGP48443 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRGP48443 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRGP48443 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRGP48443 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRGP48443 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RXRGP48443 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RXRGP48443 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRGP48443 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRGP48443 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRGP48443 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRGP48443 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRGP48443 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRGP48443 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RXRGP48443 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRGP48443 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRGP48443 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRGP48443 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRGP48443 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRGP48443 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRGP48443 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRGP48443 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRGP48443 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRGP48443 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRGP48443 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRGP48443 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRGP48443 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRGP48443 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRGP48443 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RXRGP48443 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRGP48443 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRGP48443 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRGP48443 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRGP48443 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRGP48443 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRGP48443 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRGP48443 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRGP48443 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRGP48443 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRGP48443 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRGP48443 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRGP48443 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRGP48443 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRGP48443 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRGP48443 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRGP48443 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRGP48443 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRGP48443 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRGP48443 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRGP48443 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRGP48443 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRGP48443 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRGP48443 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRGP48443 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRGP48443 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRGP48443 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRGP48443 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRGP48443 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRGP48443 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRGP48443 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRGP48443 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRGP48443 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRGP48443 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRGP48443 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRGP48443 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRGP48443 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRGP48443 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RXRGP48443 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRGP48443 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRGP48443 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRGP48443 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRGP48443 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRGP48443 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRGP48443 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRGP48443 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRGP48443 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRGP48443 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRGP48443 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRGP48443 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRGP48443 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RXRGP48443 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRGP48443 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRGP48443 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRGP48443 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRGP48443 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRGP48443 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRGP48443 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RXRGP48443 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RXRGP48443 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRGP48443 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRGP48443 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRGP48443 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRGP48443 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRGP48443 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRGP48443 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRGP48443 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRGP48443 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRGP48443 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRGP48443 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRGP48443 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms